OGSB - Ontologie, Grille et intégration
Sémantique pour la Biologie

Animation scientifique effectuée par

Objectifs

Depuis plusieurs années maintenant, les quantités de données biologiques générées par l'apparition de nouvelles technologies d'investigation du vivant (high throughput experiments) suivent une croissance exponentielle : génomes complets, structures 3D, puces à ADN, spectroscopies de masse,... Il est crucial de pouvoir mener des analyses croisées de données complexes, volumineuses et hétérogènes. Face à une telle complexité, des guides à l'analyse et à l'utilisation de ces données doivent êtres apportés. Une intégration appropriée nécessite une standardisation des formats de données et des modèles, ainsi que des ontologies, afin de rendre l'interopérabilité des informations aussi transparente que possible.

De même le traitement de ces données ne pourrait être envisagé qu'avec une solution automatisée (ou semi-automatisée), automatisation qui nécessite alors une intégration sémantique en adéquation avec les ontologies définies. Se posent alors les problèmes inévitables de la diffusion de ces données et méta-données, et de leur traitement, forcément massif. La grille informatique se profile comme une infrastructure de future génération apportant tout à la fois des réponses matérielles et sémantiques.

La réunion scientifique «Ontologie, Grille et intégration Sémantique pour la Biologie », dans la continuité des éditions précédentes , souhaite réunir les acteurs scientifiques des domaines des ontologies, de l'intégration sémantique, du calcul parallèle et distribué autour de ces questions. Les éditions précédentes de OGSB avaient réuni plus de 50 chercheurs et avait permis d'amorcer bon nombre d'échanges fructueux sur des concepts clés des disciplines concernées. Il s'agit pour les éditions futures de poursuivre les discussions et de faire potentiellement émerger de nouvelles idées ou de nouvelles pistes de recherche.

Editions précédentes:

OGSB'05 : [ détails ] 4 juillet 2005, Institut de Biologie et Chimie des Protéines (IBCP), LYON

OGSB'06 : [ détails ] 4 juillet 2006, Université de Bordeaux, BORDEAUX

Contacts:

	OGSB@ibcp.fr
Dr Christophe Blanchet	Institut de Biologie et Chimie des Protéines
Pr Christine Froidevaux	Laboratoire de Recherche en Informatique
Dr Isabelle Mougenot	Laboratoire d'Informatique, de Robotique et de Microélectronique de Montpellier

Remerciements